Департаментом профилактики заболеваний и государственного санитарно-эпидемиологического надзора Министерства здравоохранения Кыргызской Республики проводятся внутригосударственные процедуры, необходимые для вступления в законную силу Соглашения между Министерством здравоохранения Кыргызской Республики и Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Российской Федерации о сотрудничестве в области внедрения Международных медико-санитарных правил (2005 г.).
Соглашением предусматривается координация совместных действий по выявлению, предупреждению и оперативному реагированию на вспышки инфекционных заболеваний и чрезвычайные ситуации санитарно-эпидемиологического характера на территории Кыргызской Республики, обмен информацией о санитарно-эпидемиологической и эпизоотологической обстановке, а также проведение совместных учений и подготовку специалистов Кыргызской Республики по вопросам санитарно-эпидемиологической безопасности, проведение совместных научных исследований в указанном направлении. Кроме этого, Соглашение включает мероприятия по оказанию безвозмездной материально-технической помощи учреждениям Министерства здравоохранения Кыргызской Республики со стороны Роспотребнадзора для укрепления системы мониторинга за инфекционными заболеваниями и оперативного реагирования на чрезвычайные ситуации санитарно-эпидемиологического характера.